Der Stop-Motion-Film "Kubo - Der tapfere Samurai" spielt im Japan vor unserer Zeit. Der gutherzige Titelheld Kubo lebt in einer Stadt am Meer, kümmert sich um seine Mutter und erzählt gerne Geschichten. Sein Leben wird auf den Kopf gestellt, als er versehentlich einen Geist aus seiner Vergangenheit heraufbeschwört und dieser auf die Erde hinab rast, um eine alte Blutrache zu vollstrecken.

Gemeinsam mit seinen neuen Gefährten Monkey und Beetle begibt sich Kubo auf ein Abenteuer, um seine Familie zu retten und das Geheimnis um seinen als Samurai-Krieger gefallenen Vater zu lösen.