Fünf Jahre nach ihrem Verschwinden werden die Leichen eines Zwillingspärchens gefunden. Booth und Brennan kommen auf die Spur eines Serienkillers, der als "der Totengräber" bekannt ist. Der Totengräber entführt und vergräbt seine Opfer. Zahlen die Angehörigen nicht das geforderte Lösegeld, überlässt er die Entführten ihrem Schicksal. Auch Brennan und ihr Kollege Hodgins werden Opfer des Totengräbers und sind nun gezwungen, ihre eigene Entführung von einem unterirdischen Grab aus zu lösen.